电解法二氧化氯发生器的杀灭作用显着好于液氯， 二氧化氯对细菌的杀灭作用显着好于液氯，并可在pH为3－9范围内有效地杀灭细菌；而液氯只有在近中性条件（pH值为6.5－8.5）下可有效地杀死细菌；相对液氯而言，二氧化氯所需投量较少，灭菌速率快。特别二氧化氯可杀灭水中异养菌、铁细菌和硫酸盐复原菌等，且作用持久。二氧化氯的灭菌作用能继续很长时刻，在管网体系中能够坚持必定的残留。 二氧化氯对水中病毒例如脊髓灰质炎I型、柯萨奇病毒B3、艾可病毒II、腺病毒7型、单纯疱疹病毒I型、流行性腮腺炎病毒、乙肝病毒、呼吸道病毒具有很好的消毒作用；对水中的藻类和浮游生物有很好的失活作用。二氧化氯不仅能杀死微生物，而且能分解残留的细菌结构，具有杀死孢子和病毒的作用，然后能够有效地操控细菌、藻类以及粘泥。
